يتعامل المجلس العلمي مع العديد من القضايا والمهام التي وردت في نظام التعليم العالي والجامعات ومن أبرز المهام البت والتوصية في قرارات التعيين والترقية الأكاديمية والنشر العلمي والتفرغ العلمي وحضور الدورات العلمية والإستعانه بالأساتذة غير المتفرغين وغيرها من القضايا ذات العلاقة.