أُنشئت عمادة القبول والتسجيل عام 1400هـ، وتُعنى باستقبال طلبات الالتحاق بالجامعة الإسلامية، ودراستها وفق الأنظمة واللوائح المنظّمة لذلك، وتسجيل الطلاب، وإنهاء إجراءاتهم، منذ قبولهم وحتى تخرّجهم. وتندرج تحت عمادة القبول والتسجيل وكالتان هما: وكالة العمادة لشؤن القبول، ووكالة العمادة لشؤن التسجيل.
