تم إنشاء كلية القرآن الكريم بموجب الأمر السامي رقم: (26511)، بتاريخ: 1394/9/6هـ، في شهر رمضان المبارك بناء على مشورة المجلس الأعلى للجامعة الإسلامية المنعقد من تاريخ: 1394/4/12هـ، إلى تاريخ: 1394/4/20هـ. وتعد أول كلية في العالم الإسلامي، فلم يسبق المملكة العربية السعودية إلى إنشاء مثل هذه الكلية أحد، فشرط الالتحاق بهذه الكلية حفظ القرآن الكريم كاملاً. وقد بدأت الدراسة بها في يوم الاثنين الموافق: 1394/10/6هـ، وبلغ عدد طلابها (21) طالبًا، ثم زاد عدد الملتحقين بها، وبلغ إجمالي المتخرجين فيها منذ التخرج من الدفعة الأولى حتى عام: 1435/1436هـ (1524)، وينتمون إلى (75) قطرًا.