1- التخصصات الشرعـيـة
تعد التخصصات الشرعية والإسلامية أحد اللبنات الأساسية التي قامت عليها الجامعة الإسلامية بالمدينة المنورة، ولتعدد التخصصات وشموليتها فقد توزعت الأقسام العلمية على خمس كليات: كلية الشريعة، كلية العقيدة والدعوة، كلية القران الكريم والدراسات الإسلامية، كلية الحديث الشريف والدراسات الإسلامية.
تفخر الجامعة بكادر متميز من أعضاء هيئة التدريس والعلماء المتمكنين في مختلف العلوم والفنون، كالفقه الإسلامي وأصوله، والدراسات القضائية، والعقيدة، والقراءات، والتفسير، وعلوم الحديث، وفقه السنة، حيث أضحت الجامعة الإسلامية مرجعاً يشار إليه بالبنان في الأبحاث والدراسات الشرعية والإسلامية، وعنصراً فعّالاً في المؤتمرات العالمية والندوات العلمية لمعالجة القضايا المعاصرة والملحة محلياً ودولياً، وللجامعة أثراً ملموسا ، كالتحكيم القضائي التجاري، وتفسيرات النصوص النظامية، ً في العديد من المجالات العلمية والشرعية والاستشارات الشرعية، وفقه الأوقاف وإدارتها، والمصرفية الإسلامية (Islamic Banking) ، وصناعة الحلال (Halal Industry) وفقه الأوقاف وإدارتها، والقضايا الفقهية الطبية، والدراسات الفقهية التقنية.
2- التاريخ والحضارة الإسلامية.
على ضفاف وادي العقيق، وعلى بعد بضعة أميال من المسجد النبوي الشريف تستلهم الجامعة الإسلامية بالمدينة المنورة شرف المكان، وتولي عناية خاصة بتاريخ يمتد منذ فجر النبوة وحتى عهدنا الزاهر.، يضم قسم التاريخ والحضارة الإسلامية كوكبة من الخبراء الأكاديميين والباحثين والمؤرخين البارزين الذين يتواصل إثرائهم للساحة العلمية بالمؤلفات والأبحاث والدراسات التي تساهم في الحفاظ على الموروث التاريخي والثقافي للمملكة العربية السعودية، وتمتد إسهاماتهم إلى تقديم المحتوى التاريخي الموسوم بدقة التوثيق وأصالته، سواء في مجال الدراسات والاستشارات أو الدورات التدريبية لمنسوبي القطاع السياحي، أو من خلال المشاريع الثقافية والتراثية والسياحية وتقديم المحتوى التاريخي المتميز وتصميم المواقع التاريخية مما ينعكس على إثراء وتعميق تجربة السائح أثناء زيارته لمناطق المملكة العربية السعودية وخصوصاً منطقتي مكة المكرمة والمدينة المنورة.
إن القدرات البشرية المتخصصة والبيئة العلمية والبحثية المتميزة هي أهم الممكنات التي تقوم عليها الجامعة الإسلامية في الاستثمار في المعرفة التاريخية وفي تنفيذ أكبر مشاريع المحتوى التاريخي والتراثي بمكة المكرمة والمدينة المنورة مما جعل الجامعة شريكاً استراتيجياً للعديد من الجهات الحكومية كوزارة الثقافة وهيئة التراث، ودارة الملك عبد العزيز وبرنامج خدمة ضيوف الرحمن.
3- التخصصات اللغوية.
تمثل اللغة العربية وعاء للثقافة والحضارة العربية والإسلامية، فهي بفرعيها، الوصفي والتطبيقي من أهم عوامل القوة التي تتمتع بها الجامعة الإسلامية بالمدينة المنورة، فكلية اللغة العربية ومعهد تعليم اللغة العربية لغير الناطقين بها ومركز ترجمة القرآن الكريم تعدان من أعرق المؤسسات الأكاديمية التي تعنى باللغة العربية وتطبيقاتها وتعليمها وترجمتهامن خلال الأقسام العلمية: اللغويات، الأدب والبلاغة، اللغات والترجمة، إعداد وتدريب معلمي اللغة العربية لغير الناطقين بها، والإعداد اللغوي. حيث تزخر تلك الأقسام بكوكبة من اللغويين والباحثين والمدربين المتميزين. ولأن اللغة العربية تحظى باهتمام كبير فقد تم إطلاق عدد من المبادرات مثل مبادرة "نقش" والتي تهتم بفنون الخط العربي وجمالياته وتمتد اهتماماتها إلى النقوش المنتشرة في العديد من المواقع التراثية والتاريخية والأثرية بالمملكة العربية السعودية.
لقد أضحت الجامعة شريكاً استراتيجياً للعديد من الجهات المتخصصة مثل مجمع الملك سلمان العالمي للغة العربية في العديد من المشاريع المحلية والعالمية، وعددا من الجهات الحكومية الأخرى من خلال تقديم خدمات الدراسات ً والاستشارات والدورات التدريبية في التحرير وصناعة المحتوى والاتصال المؤسسي والتحكيم والمراجعة والترجمة وجمع البيانات. كما حازت الجامعة قصب السبق من خلال تجاربها الرائدة والفريدة في مجال السياحة التعليمية تلبية لرغبة كثير من المهتمين والمثقفين غير العرب في تعلم اللغة العربية بدافع التعرف على الثقافة السعودية وما تزخر به من تراث متنوع.
4- التخصصات الاقتصادية والاستشارية.
تشكل الدراسات القانونية والاقتصادية أحد الروافد المعرفية المهمة في الجامعة الإسلامية من خلال كلية الأنظمة والاقتصاد، ومركز الابتكار وريادة الأعمال، حيث تضم هذه التخصصات العديد من الأكاديميين والباحثين المزودين بخبرات أعرق المؤسسات التعليمية حول العالم في تخصصات القانون بمختلف مجالاته والاقتصاد والمالية والمحاسبة، حيث يتم ربط المعرفة النظرية بتجربة العمل في الواقع، وقد انعكست تلك المخرجات على العديد من عقود الخدمات والدراسات والاستشارات التي تقدمها الجامعة للعديد من الجهات الحكومية، مثل حاضنات الأعمال ودراسات الجدوى، والدراسات القانونية والاستشارات الاقتصادية والتسويقية والمالية، وإدارة المخاطر المالية واستمرارية الأعمال والمالية الرقمية (Fintech) والفهرسة، والخدمات الإشرافية الأكاديمية، من خلال نخبة من الخبراء والاستشاريين والمختصين.
5- التخصصات التطبيقية والتقنية.
تزخر الجامعة بالعديد من التخصصات العلمية والتطبيقية متمثلة في العديد من الكليات والمراكز العلمية والبحثية، مثل كلية الهندسة (قسم الهندسة الكهربائية- الهندسة الميكانيكية- الهندسة المدنية)، وكلية الحاسب الآلي (قسم علوم الحاسب -قسم تقنية المعلومات ) وكلية العلوم قسم الرياضيات- قسم الكيمياء-قسم الفيزياء)، ومركز الذكاء الاصطناعي ومركز الاستدامة، حيث تضم بين جنباتها العديد من الخبراء والعلماء والباحثين من مختلف أنحاء العالم، وتعد تلك التخصصات أحد مصادر القوة للجامعة وعنصراً مهما ًفي العديد من المشاريع التي تقدمها الجامعة للعديد من الجهات مثل شركة (سرك) أحدى شركات صندوق الاستثمارات السعودي (PIF) في تدوير المخلفات الصلبة، وتقديم الاستشارات التقنية في معالجة اللغات الطبيعية والذكاء الاصطناعي والتقنيات الناشئة وتوظيفها لرفع جودة الحياة وخدمة المجتمع في مجالات الصحة والمدن الذكية والمواصلات.